Fastlegeregisteret inneholder koblingen mellom borgere og deres fastlege. Oppslag i Fastlegeregisteret skal gjøres ved bruk av Web-tjener hvor Reseptformidleren sender legens og valgt pasients fødselsnummer. Web-tjenesten returnerer ja/nei og en status.Det er ett spesielt forhold rundt oppslag mot fastlegeregisteret for personer (FLR) gir en oversikt over alle landets fastleger. Registeret viser tilknytningen mellom den enkelte fastlege og innbygger.
HELFO er ansvarlig for å holde fastlegeregisteret oppdatert og kommunene har ansvaret for fastlegeordningen.
Reseptformidleren gjør oppslag mot fastlegeregisteret for å finne pasientens fastlege i forbindelse med videresending av M8 Utleveringsrapport til fastlege.
Fastlegeregisteret gir ikke informasjon om fastlege for pasienter med fortrolig og strengt fortrolig adresse, såkalt kode 6 eller 7 personer. Her vil oppslaget gi negativ tilbakemelding og det vil ikke være mulig å registrere abonnement på utleveringsrapport til fastlege for pasienter med fortrolig og strengt fortrolig adresse.